為了服務“一帶一路”倡議和自貿區戰略發展，廈門檢驗檢疫局積極深化原產地工作改革，幫助企業既享受到自貿協定關稅優惠政策提升出口競爭優勢，又獲得便利服務的“雙紅利”。該局積極跟蹤協定的簽署和實施情況，促進企業了解和參與自貿協定；開展千企幫扶計劃。截至目前，累計開展各類宣講和培訓30余次，惠及企業2000余家。c此外，還與商務部門實現了“信息共享、備案互認”工作對接，全面實現對外貿易經營者備案與原產地證申領企業備案“兩證合一”，進一步縮減業務環節；同時，依托信息化技術手段實現企業從備案、證書申請到調查，各個環節均可通過網上提交信息，不再需要提交紙質材料審核，實現了“一趟不用跑”和“最多跑一趟”的便利辦證模式。

　　該局還與廈門貿促會簽訂“合作備忘錄”，定期聯合舉辦原產地業務培訓和政策宣講會，交換簽證統計數據，共同實施專項調研；與廈門自貿委經發局簽訂“協作備忘錄”，充分利用自貿委企業服務室工作平臺，共同協商建立檢驗檢疫原產地簽證等相關政策法規宣傳、培訓工作協作機制。
　　借助廈門“單一窗口”2.0版建設契機，該局進一步優化“單一窗口”原產地免費申報端口，利用“單一窗口”出口貨物報檢功能，根據貨物的出口目的國，自動提示企業申請相應的原產地證書，確保出口商品“應享盡享”關稅減免待遇；同時在“單一窗口”增加航線查詢功能，方便企業獲知船舶中轉信息，提前準備好“未再加工證明”等文件，避免因不符合“直運規則”被退證。
　　目前，檢驗檢疫機構可以簽發的區域性優惠原產地證書有14種，涉及24個國家和地區。據統計，2017年以來，廈門檢驗檢疫局共簽發各類原產地證書23.43萬份、貨值約88.72億美元，同比增長6.41%和5.54%，其中區域性優惠原產地證書11.43萬份、貨值約37.55億美元，同比分別增長19.2%和13.55%；可享受普惠制關稅優惠的普惠制證書16251份、貨值6.2億美元，合計共幫助企業獲國外關稅減免約2.2億美元。主要簽證產品涉及鞋類、石制品、箱包和鋁制品等。